琼脂糖凝胶电泳是一项常见的技术,用于分离和检测生物分子。它利用琼脂糖凝胶的孔隙结构与分子大小之间的关系,将样品中的DNA或RNA片段按照大小进行分离。本文旨在介绍琼脂糖凝胶电泳实验流程,让我们一同探索吧!
一、琼脂糖凝胶电泳的定义
琼脂糖凝胶电泳是一种通过电泳方式,根据DNA或RNA片段的大小进行分离的方法。在施加电流时,带有负电荷的DNA/RNA会向着带有正电荷的一端迁移,而较小的片段则会迁移得更快。通过紫外线照射,可以观察到产生的条带,这就是琼脂糖凝胶电泳实验流程的依据。
二、琼脂糖凝胶的原理
琼脂糖凝胶电泳实验流程必用物质——琼脂糖,是一种高分子多糖,可以在水中形成凝胶状态。通过适当的加热溶解和冷却处理,可以制备出具有孔隙结构的琼脂糖凝胶。调整琼脂糖的浓度和制备条件可以控制孔隙的大小。由于DNA带有负电荷,在电泳槽中施加电场后,带有负电荷的DNA分子会从负极向正极移动。由于凝胶的孔隙大小不同,较大的分子会受到更大的阻力,因此移动速度较慢。相反,较小的分子则能够更轻易地通过凝胶的孔隙,因此移动速度较快。随着时间的推移,DNA分子将在凝胶中分离成不同的条带。较大的分子会停留在起始端附近,而较小的分子则会迁移到较远的正电极位置。最后,可以通过染色或其他检测方法对凝胶进行可视化,并根据条带的位置和强度来确定生物分子的大小和相对含量。
在琼脂糖凝胶电泳实验流程中,通常使用0.7~1%的琼脂糖凝胶进行日常的DNA分离,以提供对0.2~10 kb范围内片段的良好、清晰的区分效果。
三、琼脂糖凝胶电泳实验流程
(一)琼脂糖凝胶电泳实验试剂
TAE/TBE缓冲液、电泳染料、上样缓冲液、琼脂糖
(二)琼脂糖凝胶电泳实验步骤
1. 用蒸馏水清洗凝胶工具,准备好凝胶板和梳子;
2. 根据所需分离的样品(DNA)大小制备适当浓度的琼脂糖凝胶。以1.2%凝胶为例,精确称取0.48g琼脂糖干粉,加入到适量的锥形瓶中,加入约40mL TAE电泳缓冲液,放入微波炉加热融化,待凉后即可;
3. 摇晃琼脂溶液使其混合均匀,加入1 μl电泳颜料,倒入电泳槽中,等待凝固;
4. 在室温下等待约30-40分钟,小心地拔出梳子,取出已凝固的凝胶放入电泳槽中,准备上样;
5. 倒入TAE电泳缓冲液,去除凝胶孔内的气泡;
6. 上样,将5μl DNA样品加入2μl装载缓冲液中,用移液枪充分混合后加入凝胶孔中;
7. 完成上样后,接通电源,红色为正极,黑色为负极,将样品孔设为负极,设定电压为40-50v,大约电泳30分钟即可(<40分钟);
8. 电泳结束后,关闭电源,使用凝胶成像仪观察电泳位置并与DNA marker进行比对,以判断大小。
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