在Nature Commun上的一篇文章提出诱发癌症的一个重要成因是DNA甲基化的缺失。实验表明DNA低甲基化是直接由增殖相关的DNA复制驱动的。在甲基化结构域(PMD)中，富含T的直接环境(PMD单独的WCGW)中低密度CpG的DNA甲基化缺失追踪了原代细胞培养中的累积种群倍增。细胞周期减速导致了DNA低甲基化率成比例下降。

在此期间，原癌基因甲基化水平会降低，抑癌基因和DNA修复基因由于超甲基化而沉默，这会使得癌细胞增殖加强，细胞的增殖不再受控制形成肿瘤。

因此，特定基因的甲基化程度可以作为肿瘤筛查的指标。

一、Zymo-Seq™ Cell Free DNA WGBS Library Kit产品介绍

美国 ZYMO RESEARCH可以为您提供了从cfDNA的提取、纯化、甲基化修饰、文库构建的一整套解决方案~

Zymo-Seq™ Cell Free DNA WGBS Library Kit 可用于cfDNA构建WGBS文库。这个通用试剂盒操作流程非常简单，能快速上手，低至5ng的cfDNA 也能制备出高质量的甲基化文库，完成只需要三个基本的步骤：1.亚硫酸氢盐转化；2.直接接头连接；3.PCR扩增。

1、工作原理&测试数据

亚硫酸氢钠处理对于cfDNA是温和的，转化任何未经修饰的胞嘧啶为尿嘧啶的效率也非常高。本试剂盒的拼接接头可以捕获Illumina兼容的接头并将其连接到任何长度的DNA片段上，因此可以对受损的、微量的DNA片段进行测序。接头的直接连接还能消除对第二链合成、末端修复以及dA拖尾等步骤的依赖，从而可以通过保持片段末端存在的任何原始甲基化的完整性来减少实验偏差。最后通过使用Zymo Seq UDI的PCR对连接接头的cfDNA进行 index 扩增，生成可以在任何 Illumina仪器上测序的文库。

2、产品优势

※ 可对小片段样品进行处理：适用于损伤的或小的DNA片段例如cfDNA。

※ 具有准确的甲基化响应：直接连接接头，可准确读长。
※ 操作流程简单：只需3个步骤即可制备高质量甲基化测序文库。

3、实验结果

取健康和癌症供体血浆样本提取cfDNA，使用Zymo-Seq™ Cell Free DNA WGBS Library Kit 制备 cfDNA WGBS文库，并使用Agilent 4200 TapeStation HS D1000 进行文库凝胶分析，其中A1是对照，B1是从59岁健康供体中制备的文库，C1是从66岁癌症非小细胞肺癌供体中制备的文库，D1是从69岁腺癌组织中制备的文库。所有文库输入的 cfDNA 起始量均为5ng，扩增循环数为9个。

二、超值福利来袭

免费试用1：

cfDNA提取试剂盒（磁珠法)

数量：20套(每个实验室只能领取1套)

产品优势：

※ 可以从小于10ml的血清/血浆、小于1ml的脑脊液或羊水中提取出高纯度的cfDNA；

※ 提取获得的DNA纯度好、产量高，可直接用于酶切、PCR、高通量测序等分子生物学实验。

※ 化学修饰磁珠可以完美结合cfDNA。

高线性相关性：

※ 输入三种不同体积的cfDNA提取

※ 输入量与回收率呈线性相关

操作简单：

※ 可以手动操作完成整个提取流程

※ 兼容主流自动化平台，实现自动化提取

高样本兼容性：

※兼容的采血管：K2EDTA、K3EDTA、Streck-DNA、柠檬酸钠、Na-F/K-草酸钠、Na2EDTA

※ 兼容：血浆、血清、脑脊液、羊水、唾液、尿

※不兼容：滑膜液、肝素

免费试用2：

cfDNA提取试剂盒（离心柱）

数量：20套(每个实验室只能领取1套)

产品优势：

※ 可以从小于10ml的血清/血浆，小于1ml的脑脊液或羊水中提取出高纯度的cfDNA。
※ 提取的DNA纯度好、产量高，可以直接用于酶切、PCR、高通量测序等分子生物学实验。

 数据对比：

本试剂盒与Q公司cfDNA提取试剂盒从不同体积血浆中提取到的cfDNA数据。

（1）使用cfDNA提取试剂盒从不同体积的血浆中提取到的cfDNA。

（2）使用cfDNA提取试剂盒从孕妇血浆，羊水，脑脊液中提取到的总DNA。

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